Halkalı-Gebze arası 75.7 km uzunluğunda olup 108 dakika; Ataköy-Pendik arası 42,83 km uzunluğunda olup 63 dakika seyahat süresi ile hizmet verilmektedir.

Marmaray trenleri hızları olumsuz bir durum oluşmadığı sürece seyahat süreleri bu plan dahilinde tamamlanacak şekilde otomatik olarak ayarlanmaktadır.